Эти работы по исследованию желудочного пищеварения проводились уже в новой лаборатории И. П. Павлова – во вновь открытом в то время Институте экспериментальной медицины. Работа И. П. Павлова в Боткинской лаборатории приносила ему огромное творческое удовлетворение, но сама лаборатория была недостаточно удобна. Не хватало ни места, ни средств. Вот почему И. П. Павлов с радостью принял в 1890 году предложение взять на себя заведование отделом физиологии во вновь организуемом Институте экспериментальной медицины. Здесь И. П. Павлов и построил по своему вкусу «чистую операционную» для экспериментов на собаках, которая ни в чем не уступала человеческой операционной. После этого количество успешных операций стало повышаться, и И. П. Павлов смог осуществить все свои творческие замыслы. Работа привлекла всеобщее внимание, и лаборатория Ивана Петровича Павлова стала излюбленным местом для диссертантов, прикомандированных и всякого рода энтузиастов научного исследования как русских, так и иностранных. Это позволило И. П. Павлову произвести огромное количество научных исследований.