В целях распространения знаний среди сельских хозяев Докучаев организовал в Петербурге курс общедоступных лекций для земледельцев, в чтении которых участвовали виднейшие ученые, в том числе и Д. И. Менделеев.
Много труда В. В. Докучаев отдал составлению новой почвенной карты Европейской России. К 1900 году карта была составлена и напечатана. Эта карта с тех пор служила основой всех работ ведомства земледелия вплоть до 1930 года. Руководство институтом в Новой Александрии в сочетании с большой общественной деятельностью стоили В. В. Докучаеву большого напряжения сил. Под конец он заболел и должен был выйти в отставку.